В-ДНК

При дослідженні синтетичних молекул ДНК було показано, що ДНК може приймати різні конформації. Найбільш часто зустрічається наведена тут В-форма ДНК. Як зазначалося на с. 90, молекула складається з двох антипаралельних полідезоксінуклеотідних ланцюгів, які закручені в праву подвійну спіраль.

Остов цього тяжа утворений залишками дезоксирибози і фосфатними угрупованнями, з’єднаними фосфодіефірнимі зв’язками. Остов одного ланцюга виділений темно-синім кольором, другий – синім, а підстави обох ланцюгів – блакитним. Ароматичні кільця відстоять один від одного на 0,34 нм і майже перпендикулярні осі спіралі. Кожна основа повернуто по відношенню до попереднього на 35о. На кожен виток подвійної спіралі (360о) припадає приблизно 10 пар основ, хід спіралі – 3,4 нм. Між остовами двох окремих ланцюгів є дві широкі борозенки. Велика борозенка видна на моделі знизу і зверху, мала борозенка – в центрі. ДНК-асоційовані білки (див. Сс. 120, 366) взаємодіють з найбільш доступними підставами в області великої борозенки. Просторові співвідношення між остовом і підставами більш наочно видно на моделі одинарної ланцюга (праворуч). На всіх моделях аденін забарвлений в жовтий колір, а комплементарний йому тимін – в оранжевий. На вигляді зверху (у центрі; один ланцюг вище іншої) підстави проглядаються найбільш повно.
У певних умовах ДНК може приймати А-конформацію (на схемі не приведена). При такому розташуванні зберігається права подвійна спіраль, проте на відміну від B-форми підстави вже не перпендикулярні осі, а перебувають під іншим кутом. У Z-конформації (на схемі не приведена), яка може утворюватися в ділянках В-ДНК, багатих GC, розташування нуклеотидів зовсім інше: подвійна спіраль скручена вліво, а кістяк має характерну зигзагоподібну форму (звідси Z-конформація, або Z-ДНК) .


1 Star2 Stars3 Stars4 Stars5 Stars (2 votes, average: 3.50 out of 5)

В-ДНК