В-ДНК
При дослідженні синтетичних молекул ДНК було показано, що ДНК може приймати різні конформації. Найбільш часто зустрічається наведена тут В-форма ДНК. Як зазначалося на с. 90, молекула складається з двох антипаралельних полідезоксінуклеотідних ланцюгів, які закручені в праву подвійну спіраль.
Остов цього тяжа утворений залишками дезоксирибози і фосфатними угрупованнями, з’єднаними фосфодіефірнимі зв’язками. Остов одного ланцюга виділений темно-синім кольором, другий – синім, а підстави обох ланцюгів – блакитним. Ароматичні кільця відстоять один від одного на 0,34 нм і майже перпендикулярні осі спіралі. Кожна основа повернуто по відношенню до попереднього на 35о. На кожен виток подвійної спіралі (360о) припадає приблизно 10 пар основ, хід спіралі – 3,4 нм. Між остовами двох окремих ланцюгів є дві широкі борозенки. Велика борозенка видна на моделі знизу і зверху, мала борозенка – в центрі. ДНК-асоційовані білки (див. Сс. 120, 366) взаємодіють з найбільш доступними підставами в області великої борозенки. Просторові співвідношення між остовом і підставами більш наочно видно на моделі одинарної ланцюга (праворуч). На всіх моделях аденін забарвлений в жовтий колір, а комплементарний йому тимін – в оранжевий. На вигляді зверху (у центрі; один ланцюг вище іншої) підстави проглядаються найбільш повно.
У певних умовах ДНК може приймати А-конформацію (на схемі не приведена). При такому розташуванні зберігається права подвійна спіраль, проте на відміну від B-форми підстави вже не перпендикулярні осі, а перебувають під іншим кутом. У Z-конформації (на схемі не приведена), яка може утворюватися в ділянках В-ДНК, багатих GC, розташування нуклеотидів зовсім інше: подвійна спіраль скручена вліво, а кістяк має характерну зигзагоподібну форму (звідси Z-конформація, або Z-ДНК) .
Related posts:
- Структура ДНК Парування підстав, проілюстроване на схемі А, охоплює в молекулі ДНК мільйони ланок. Звичайно, це можливо тільки в тому випадку, якщо полярність обох ланцюгів різна, тобто обидві ланцюга мають протилежні напрямки (див. с. 86). Крім того, обидві ланцюга повинні бути закручені у вигляді подвійної спіралі. Через стеріческіх обмежень, викликаних 2′-ОН-групою залишку рибози, РНК не мoгyт утворювати […]...
- Вторинна структура ДНК Під вторинною структурою розуміють просторову організацію полінуклеотидних ланцюга. Згідно моделі Уотсона-Кріка молекула ДНК складається з двох полінуклеотидних ланцюгів, правозакрученной навколо спільної осі з утворенням подвійної спіралі. Пуринові і піримідинові підстави направлені всередину спіралі. Між пуріновим підставою одного ланцюга і пірімідіновим підставою іншого ланцюга виникають водневі зв’язки. Ці основа – ня складають комплементарні пари. Водневі зв’язки […]...
- Вторинні структури білків Певні поєднання двогранних кутів φ і ψ (див. С. 72) зустрічаються в білках досить часто. Якщо безліч послідовно пов’язаних амінокислотних залишків приймає стандартні конформації, формуються вторинні структури, стабілізовані водневими містками в межах однієї пептидного ланцюга або між сусідніми ланцюгами. Якщо така регулярна структура поширюється на досить великий фрагмент молекули білка, такий білок утворює механічно міцні […]...
- Послідовність реплікаційного синтезу ДНК 1. ДНК-геліказу розкручує ділянку подвійної спіралі ДНК і розриває водневі зв’язки. Утворюється реплреплікаційна вилка. 2. Дестабілізуючі білки випрямляють ділянку ланцюга ДНК 3. ДНК-топоізомераза розриває фосфодіефірную зв’язок в одній з полінуклеотидних ланцюгів ДНК, знімаючи напругу, що викликається розплітання спіралі і розбіжністю ланцюгів в вилці реплікації. 4. РНК-праймаза синтезує РНК-затравки для дочірньої ланцюга і для кожного фрагмента […]...
- Характеристика процесів синтезу ДНК в організмах Синтез ДНК або реплікація ДНК (редуплікація) – один з найважливіших еколого-біологічних процесів, від якого залежить існування живих істот, і на який негативний вплив роблять різні процеси, що протікають в навколишньому середовищі. Реплікація – це класичний приклад матричного синтезу (синтезу на певній основі), широко зустрічається в природі. Розглянемо деякі особливості реплікації. Перед початком реплікації змінюється структура […]...
- Рhе-тРНК Молекули РНК не можуть утворювати подвійну спіраль і тому не настільки високоупорядочені в порівнянні c ДНК. Як приклад тут наведена молекула тРНК з дріжджів. Нуклеотидна послідовність цієї тРНК і загальні принципи будови тРНК обговорювалися раніше (див. С. 88). За аналогією з іншими моделями, наведеними на схемі А, підстави пофарбовані в блакитний колір, кістяк із залишків […]...
- Реплікація Механізм дії ДНК-полімерази Для передачі дочірнім клітинам генетичної інформації в процесі реплікації ДНК (DNA) повинна бути створена копія генома. Реплікація ДНК здійснюється ДНК-залежними ДНК-полімерази. Ці ферменти використовують як шаблон одну з ланцюгів подвійної спіралі ДНК, так звану матрицю. На матриці, починаючи з короткою стартовою послідовності (праймера), ферменти синтезують комплементарную ланцюг і відтворюють в підсумку вихідну […]...
- Спіраль Архімеда Архімедового спіраль – плоска крива сформована траєкторією довільної точки, що рівномірно рухається по променю що бере свій початок в O, одночасно з цим сам промінь розмірено звертається навколо O. Перефразувавши отримуємо, відстань ρ пропорційно кутку обороту φ променя. Обігу променя на однаковий кут відповідає одне і те ж збільшення ρ. . Рівняння, що характеризує Архимедову […]...
- Глобулярні білки На відміну від нерозчинних фібрилярних білків розчинні білки мають майже сферичну (глобулярну) форму. Глобулярним білкам властива високоупорядоченной просторова структура (конформація), яка сприяє виконанню специфічних біологічних функцій. У даному розділі розбираються особливості будови глобулярних білків на прикладі невеликого білка інсуліну (див. Сс. 82, 162). А. Інсулін: первинна структура Під первинною структурою розуміють амінокислотнихпослідовність поліпептидного ланцюга. Інсулін […]...
- Структура полісахаридів Полісахариди, побудовані з моносахаридних ланок одного типу, називаються гомоглікани, а побудовані з різних моносахаридних ланок – гетероглікани. Обидва полімеру можуть бути лінійними або розгалуженими. Як приклад розгалуженого гомоглікана тут представлений фрагмент молекули глікогену. Схожу будову має амилопектин, розгалужений компонент рослинного крохмалю (див. С. 48). Обидва полімеру побудовані в основному з залишків глюкози, пов’язаних в положенні […]...
- Структурні білки Структурні білки надають екстрацелюлярним структурам механічну міцність, а також беруть участь у побудові цитоскелету (див. С. 206). У більшості структурних білків переважає одна з вторинних структур (див. С. 74), що зумовлюється їх амінокислотним складом. А. α-Кератин Структурним білком, побудованим переважно у вигляді α-спіралі, є α-кератин. Волосся (шерсть), пір’я, голки, кігті і копита тварин складаються головним […]...
- Нуклеїнові кислоти. Хімія спадковості ДНК – це надзвичайно довгі полімерні ланцюги, що складаються з багатьох тисяч з’єднаних один з одним мономерних одиниць – дезоксірібонуклеотідов чотирьох різних типів, що утворюють характерні для кожного організму специфічні послідовності. Молекули ДНК зазвичай складаються з двох частин. Функції ДНК полягають у тому, що вона зберігає запас генетичної інформації, необхідної для кодування структури всіх білків […]...
- Третинна структура ДНК ДНК мають форми: лінійна, кільцева, 2-х і 1 ланцгова. Двухланцюгові ДНК з “липкими” кінцями можуть утворювати кільце, яке далі ковалентно зшивається по сахарофосфатний ланцюга за допомогою ДНК-лігази. Третинна структура ДНК у еукаріотів відрізняється тим, що багаторазова спирализация ДНК супроводжується утворенням комплексів з білками. 46 хромосом (хроматид) людини організовані в 23 пари. Середня довжина хромосоми становить […]...
- Згортання білків Інформація щодо біологічно активної (нативної) конформації поліпептидного ланцюга закодована в амінокислотної послідовності. Вторинні, третинні і четвертинні структури багатьох білків утворюються в розчині мимовільно в межах декількох хвилин. Проте в клітці є спеціальні білки (шаперони, див. С. 230), функція яких забезпечувати згортання поліпептидних ланцюгів знову синтезованих білків. З’ясування закономірностей згортання поліпептидних ланцюгів є однією з найважливіших […]...
- Біосинтез антитіл Варіабельність імуноглобулінів Незважаючи на схожість своєї основної структури імуноглобуліни (Ig) надзвичайно різноманітні. Вважається, що в організмі людини є приблизно 108 різних варіантів антитіл. Варіабельність Ig відноситься як до легких, так і важких ланцюгів. Є п’ять різновидів важких H-ланцюгів (α, β, ε, γ і μ, див. С. 288), які й визначають класи антитіл, і два різновиди […]...
- Фізико-хімічні властивості ДНК Молекулярна маса ДНК визначається рядом методів, в тому числі: Ультрацентрифугуванням в градієнті CsCl (ММ від 200 000 до 109); По в’язкості розчинів (для НК з ММ> 109, оскільки при центрифугуванні такі довгі молекули розриваються під дією власної ваги). Денатурація ДНК полягає в розриві Н-зв’язків і стекінг-взаємодій, що призводить до розплітання і поділу ланцюгів (без розриву […]...
- Рецептор для антигену t-лімфоцитів Антигенразпізнаючих Рц T-лімфоцитів – TCR-належать до надсемейству імуноглобулінів (див. Рис. 5.1). Виступаючий над поверхнею клітини Аг-розпізнає ділянку TCR – гетеродімер (тобто складається з двох різних поліпептидних ланцюгів) – аналог одного Fab-фрагмента Ig. Відомі два варіанти TCR, що позначаються як TCRαβ і TCRγδ; ці варіанти розрізняються складом поліпептидних ланцюгів Аг-розпізнає ділянки. Кожен T-лімфоцит несе тільки один […]...
- Логарифмічна спіраль Будь-якій людині, яка сумнівається в тісному і нерозривному зв’язку математичних явищ з явищами природи треба як доказ продемонструвати яскраві і дивно наочні приклади цього дивовижного сусідства: раковини равликів і молюсків, морські коники, папороті, океанські хвилі, лусочки соснової шишки, павутина, яку плетуть деякі види павуків, насіння соняшнику та ін. являють собою не що інше, як математичну […]...
- Гени і білки Відомо, що всі ферменти є білками і каталітична активність ферменту визначається його білкової частиною і додатковими кофакторами. Білки, що складаються з амінокислот, які з’єднуються між собою Аміна і карбоксильних кінцями, називаються поліпептидами. Каталітична активність ферменту залежить від кількості і типу входять до нього амінокислот, порядку їх розташування по ланцюгу, кількості ланцюгів і характеру їх взаємного […]...
- Структура імуноглобулінів Антитіла (імуноглобуліни) – це білки, які синтезуються під впливом антигену і специфічно з ним реагують. Вони складаються з поліпептидних ланцюгів. У молекулі імуноглобуліну розрізняють чотири структури: 1) первинну – це послідовність певних амінокислот. Вона будується з нуклеотидних триплетів, генетично детермінується і визначає основні наступні структурні особливості; 2) вторинну (визначається конформацией поліпептидних ланцюгів); 3) третинну (визначає […]...
- Матричні біосинтези Синтез нерегулярних лінійних полімерів – білків і нуклеїнових кислот – відбувається матричним способом. Тільки таким чином можна точно відтворити послідовність мономерів в полімерній молекулі. При синтезі ДНК матрицями служать кожна з ланцюгів “материнської” молекули ДНК. Вибір потрібних нуклеотидів для будівництва нового ланцюга здійснюється за принципом їх комплементарності. Результатом синтезу є дві подвійні “дочірні” спіралі, кожна […]...
- Будова нуклеїнових кислот Нуклеїнові (від лат. Nucleus – ядро) кислоти, так само як і білки, – нерегулярні лінійні полімери. Мономерами нуклеїнових кислот є нуклеотиди. Вони виходять при неповному гідродизі нуклеїнових кислот. Повний гідроліз призводить до утворення фосфорної кислоти, цукру-пентози і азотистих основ. Таким чином, нуклеотид складається із залишку фосфорної кислоти, моносахарида і азотистого підстави. Існує два види нуклеїнових […]...
- Сортування білків Транспорт білків Біосинтез білків починається на вільних рибосомах (на схемі вгорі). Однак незабаром шляху синтезованих білків розходяться відповідно до їх функцією: білки, що несуть на N-кінці сигнальний пептид для ЕР (1), проходять через секреторний шлях (на схемі праворуч), а інші білки, що не мають цієї сигнальної послідовності, слідують по цитоплазматичних шляху (на схемі зліва). Секреторний […]...
- Транскрипція і трансляція білка Синтез білків – це складний багатоетапний процес, основними його етапами є: Транскрипція – зчитування і копіювання гена в структуру інформаційної РНК; Трансляція – використання і-РНК як матрицю, по якій збирається молекула білка. Транскрипція відбувається в ядрі – фермент РНК-полімераза приєднується до спеціальній ділянці ДНК, який називається “промотор” і починає рухатися по ньому. При цьому подвійна […]...
- Олігосахарид з імуноглобуліну IgG Багато білки зовнішньої сторони плазматичних мембран і більшість секретується білків містять олігосахаридних ланцюги, які синтезуються в процесі посттрансляционной модифікації в ЕПР і в апараті Гольджі (див. С. 226). Цитоплазматичні білки, навпаки, рідко бувають глікозовані. Глікопротеїни можуть містити до 50% вуглеводів, але, як правило, в молекулі переважає білкова частина. Як приклад на схемі представлена структура олігосахариду […]...
- Закон Ома для повного кола струму Закон Ома є формулою, яка наочно демонструє залежність головних характеристик електричного кола: Електричного струму (потоку заряджених частинок); Напруги (електрорушійної сили); Опору (протидія потоку електронів). Що б кращого усвідомити закону Ома, для початку слід визначитися з таким поняттям як електричний ланцюг. Говорячи спрощено, будь-який електричний ланцюг – це шлях в електричній схемі, по якому проходять електричні […]...
- Нуклеїнові кислоти, Нуклеотид Нуклеїнові кислоти – біополімери, структурними одиницями яких є нуклеотиди. Нуклеотид – мономер нуклеїнових кислот, що складається із залишку фосфорної кислоти, вуглеводного залишку (дезоксирибози або рибози), одного з чотирьох азотистих основ. Азотисті основи приєднуються до першого вуглецевого атома Пента-зи, залишок фосфорної кислоти – до п’ятого. Азотисті сполуки – циклічні сполуки, що входять до складу нуклеотидів. Азотисті […]...
- Білки: характеристика та властивості Які речовини називаються білками або протеїнами? Білки, або протеїни, являють собою біологічні полімери, мономерами яких є амінокислоти. Всі амінокислоти мають аміногрупу (-NH2) і карбоксильну групу (-СООН) і розрізняються будовою і властивостями радикалів. Амінокислоти пов’язані між собою пептидними зв’язками, тому білки називають ще поіипептидами. Що таке первинна структура білка? У молекулі білка амінокислоти пов’язані один з […]...
- Ланцюги змінного струму Отримані співвідношення між амплітудами струмів і напруг, а також визначають зсув фаз між ними, дозволяють розрахувати характеристики будь-якого ланцюга змінного струму. Принципово методика розрахунку характеристик ланцюгів змінного струму не відрізняється від методики розрахунку ланцюгів постійного струму – фізичні закони, виражені в правилах Кірхгофа, справедливі для миттєвих значень струмів і напруг на будь-якій ділянці ланцюга. Однак […]...
- Трофічні ланцюги і мережі Кожна з екосистем характеризується наявністю трофічних ланцюгів і мереж: Ланцюгом харчування називається послідовно пов’язана харчовими відносинами група видів. Кожне з попередніх ланок ланцюга є їжею для наступного. Так, прикладом ланцюга харчування може служити послідовність: Рослини – комахи – пуголовок – форель – донні сапрофіти. При кожному переході речовини від однієї ланки до іншого відбувається втрата […]...
- Біосинтез жирних кислот Біосинтез жирних кислот каталізується синтазою жирних кислот. Ця ферментна система локалізована в цитоплазмі і потребує якості затравки в ацетил-КоА. У циклічної реакції одна молекула подовжується семикратно на С2-ланки. В якості кінцевого продукту реакції утворюється аніон С16-кислоти, пальмітат. Фактичний субстрат реакції подовження ланцюга Малоні-КоА на кожній стадії конденсації отщепляет карбоксильну групу в виду СО2. Відновлювачем в […]...
- Будову білка 1. Амінокислоти. Пептидний зв’язок. Амінокислоти, з’єднані один з одним послідовно, утворюють первинну структуру білка, або поліпептидного ланцюга. Кожна амінокислота має групу – NH2, яка має властивості підстави, і групу – СООН, характерну для всіх органічних кислот. Отже, амінокислоти – амфотерні сполуки, що поєднують властивості кислоти і основи. Вони здатні взаємодіяти один з одним. Взаємодіючи з […]...
- Змішані електричні ланцюги Змішаним з’єднанням елементів називають всілякі поєднання послідовної і паралельної різновидів з’єднань. В такому колі можливо різна кількість вузлів і гілок. Електричне коло зі змішаним з’єднанням елементів Змішаним вважають таке з’єднання, при якому в ланцюзі існують групи опорів, включених паралельно і послідовно. Якщо все опору в цій схемі приймаються за однакові, тобто це виглядає таким чином: […]...
- Антибіотики – конспект Антибіотики: загальні відомості Антибіотики – речовини, що синтезуються мікроорганізмами і пригнічують розмноження бактерій та інших мікробів, а також вірусів і клітин. Сьогоднішню медицину неможливо уявити собі без антибіотиків. Речовини, які пригнічують розмноження бактерій, називаються бактериостатика (у разі грибів – фунгіостатікамі); про речовини, що вбивають бактерії, кажуть, що вони мають бактерицидну (або фунгіцидною у разі грибів) […]...
- Схема заміщення асинхронного двигуна При практичних розрахунках замість реального асинхронного двигуна, на схемі його замінюють еквівалентною схемою заміщення, в якій електромагнітна зв’язок замінена на електричну. При цьому параметри ланцюга ротора наводяться до параметрів ланцюга статора. По суті, схема заміщення асинхронного двигуна аналогічна схемі заміщення трансформатора. Різниця в тому, що у асинхронного двигуна електрична енергія перетворюється в механічну енергію (а […]...
- Структура молекули ДНК Молекула ДНК – це біополімер, в складі якого основним мономером або структурною одиницею є нуклеотид. Входять до складу нуклеотидів наступні компоненти: залишок фосфорної кислоти з’єднується з п’ятивуглецевим цукром – дезоксирибозою і вбудовується в азотистих основ. Між собою мономери об’єднуються в довгі ланцюги, утворюючи в кінцевому підсумку подвійні спіралі. З’єднання спіралей один з одним відбувається за […]...
- Робота електричного струму Як обчислити роботу електричного струму? Ми вже знаємо, що напруга на кінцях ділянки кола чисельно дорівнює роботі, яка здійснюється при проходженні по цій ділянці електричного заряду в 1 Кл. При проходженні за цією ж ділянкою електричного заряду, рівних не 1 Кл, а, наприклад, 5 Кл, вчинена робота буде в 5 разів більше. Таким чином, щоб […]...
- Пасивні елементи електричного кола Резистор, індуктивність і ємність є пасивними елементами електричного кола. Резистор r або активний опір ланцюга – це елемент, в якому відбувається розсіювання енергії у вигляді тепла або перетворення електричної енергії в інший вид енергії: світлову, хімічну або механічну. Індуктивність L і ємність C називаються реактивними елементами ланцюга, в них відбуваються накопичення енергії у вигляді магнітного […]...
- Номенклатура алкенів Номенклатура алкенів вельми схожа з номенклатурою алканів за тим винятком, що наявність кратного зв’язку викликає появу ізомерів її положення, а також і ізомерів вуглецевого скелета. У ряді випадків з’являється геометрична просторова ізомерія. Всі ці особливості враховуються при складанні найменувань алкенів. При найменуванні алкенів за основу вибирається найбільш довгий ланцюг вуглецевих атомів, що включає в себе […]...
- Передача генетичної інформації в ряді клітинних поколінь У земному житті способом утворення нових клітин є мітотичний поділ вже існуючих. Цей процес організований у формі митотического (пролиферативного) циклу, вирішального найважливішу біоінформаційні-генетичну задачу – забезпечення клітин дочірніх поколінь генетичною інформацією, повноцінної в кількісному і якісному (смисловому) відношенні. Структура циклу і принципи його регуляції розглянуті в розділі 3. Тут же мова йде про процес самокопірованія […]...