Характеристика активного центру білків
Активний центр білка-відносно ізольований від навколишнього білок середовища ділянку, сформований амінокислотними залишками. У цьому ділянці кожен залишок завдяки своєму індивідуальним розміром і функціональних групах формує ” рельєф ” активного центру.
Об’єднання таких амінокислот в єдиний функціональний комплекс змінює реакційну здатність їх радикалів, подібно до того, як змінюється звучання музичного інструменту в ансамблі. Тому амінокислотні залишки, що входять до складу активного центру, часто називають ” ансамблем ” амінокислот.
Унікальні властивості активного центру залежать не тільки від хімічних властивостей формують його амінокислот, але і від їх точної взаємної орієнтації в просторі. Тому навіть незначні порушення загальної конформації білка в результаті точкових змін його первинної структури або умов навколишнього середовища можуть призвести до зміни хімічних і функціональних властивостей радикалів, що формують активний центр, порушувати зв’язування білка з лігандом і його функцію. При денатурації активний
Центр білків руйнується, і відбувається втрата їх біологічної активності.
Часто активний центр формується таким чином, що доступ води до функціональних групах його радикалів обмежений, тобто створюються умови для зв’язування чи ганда з радикалами амінокислот.
У деяких випадках ліганд приєднується тільки до одного з атомів, котрий володіє певною реакційною здатністю, наприклад приєднання 02 до заліза міоглобіну або гемоглобіну. Однак властивості даного атома вибірково взаємодіяти з 02 визначаються властивостями радикалів, оточуючих атом заліза у складі гема. Гем міститься і в інших білках, таких як цитохроми. Однак функція атома заліза в цитохромах інша, він служить посередником для передачі електронів від однієї речовини іншого, при цьому залізо стає те двох-, то тривалентним.
Центр зв’язування білка з лігандом часто розташовується між доменами. Наприклад, протеолітичний фермент трипсин, який бере участь у гідролізі пептидних зв’язків харчових білків в кишечнику, має 2 домену, розділених борозенкою. Внутрішня поверхня борозенки формується амінокислотними радикалами доменів, що стоять у поліпептидного ланцюга далеко один від одного (Сер ] 77, Гіс40, Дсп83).
Різні домени в білку можуть переміщатися один щодо одного при взаємодії з лігандом, що полегшує подальше функціонування білка. Як приклад можна розглянути роботу гексокінази, ферменту, що каталізує перенесення фосфорного залишку з АТФ на молекулу глюкози (при її фосфорит-ровании). Активний центр гексокінази розташовується в ущелині між двома доменами (рис. 1-26) При зв’язуванні гексокінази з глюкозою навколишні її домени зближуються, і субстрат виявляється в ” пастці “, що полегшує його подальше фосфорилирование.
Основна властивість білків, що лежить в основі їх функцій,-вибірковість приєднання до певних ділянок білкової молекули специфічних лігандів.
Related posts:
- Будова білків – коротко Беки відносяться до лінійних полімерів. У їх складі можуть бути присутні кілька α-аміокіслот і неаміноктслотні компоненти. На перший погляд все 20 амінокислот – це невеликий вибір. Але насправді молекула білка, що складається всього з 5 компонентів амінокислот, може мати понад мільйон варіантів побудови. Невеликий білок може мати в своїй ланцюжку сотню амінокислотних залишків. При синтезі […]...
- Фізіологічна характеристика дихального центру За сучасними уявленнями, дихальний центр – це сукупність нейронів, що забезпечують зміну процесів вдиху і видиху та адаптацію системи до потреб організму. Виділяють кілька рівнів регуляції: 1) спинальний; 2) бульбарний; 3) супрапонтіальний; 4) корковий. Спинальний рівень представлений мотонейронами передніх рогів спинного мозку, аксони яких іннервують дихальні м’язи. Цей компонент не має самостійного значення, оскільки підпорядковується […]...
- Первинна структура білків Амінокислотні залишки в пептидного ланцюга білків чергуються не випадковим чином, а розташовані в певному порядку. Лінійну послідовність амінокислотних залишків у поліпептидному ланцюзі називають ” первинна структура білка “. Первинна структура кожного індивідуального білка закодована в ділянці ДНК, званому геном. У процесі синтезу білка інформація, що знаходиться в гені, спочатку переписується на мРНК, а потім, використовуючи […]...
- Рзноманіття лігандів – Ліганди можуть бути неорганічні (часто іони металів) і органічні речовини, низькомолекулярні і високомолекулярні речовини; – існують ліганди, які змінюють свою хімічну структуру при приєднанні до активного центру білка (зміни субстрату в активному центрі ферменту); – існують ліганди, що приєднуються до білка тільки в момент функціонування (наприклад, 02, що транспортується гемоглобіном), і ліганди, постійно звязані […]...
- Денатурація білків Розрив великої кількості слабких зв’язків в молекулі білка призводить до руйнування її нативної конформації. Так як розрив зв’язків під дією різних факторів носить випадковий характер, то молекули одного індивідуАльного білка набувають у розчині форму випадково сформованих безладних клубків, що відрізняються один від одного тривимірною структурою. Втрата нативної конформації супроводжується втратою специфічної функції білків. Цей процес […]...
- Білки: характеристика та властивості Які речовини називаються білками або протеїнами? Білки, або протеїни, являють собою біологічні полімери, мономерами яких є амінокислоти. Всі амінокислоти мають аміногрупу (-NH2) і карбоксильну групу (-СООН) і розрізняються будовою і властивостями радикалів. Амінокислоти пов’язані між собою пептидними зв’язками, тому білки називають ще поіипептидами. Що таке первинна структура білка? У молекулі білка амінокислоти пов’язані один з […]...
- Перетравлювання і всмоктування білків Перетравлення білків починається в шлунку. Пепсин гідролізує 10 – 15% білків їжі. Ендопептідази (трипсин, хімотрипсин) розщеплюють білки до поліпептидів; екзопептідази отщепляют амінокислоти. Під впливом ендо – і екзопептідази панкреатичного соку і ферментів щіткової облямівки еритроцитів поліпептиди і оліго-пептиди розщеплюються до амінокислот, які транспортуються через мембрану в цитозоль клітин епітелій. Частина оліго-пептидів піддається внутрімембранному переварюванню, расщепляясь […]...
- Значення білків для організму Як ми побачили з вищенаведених функцій і особливостей, білки мають величезне значення для організму людини. Вони надають форму клітин і тканин організму, переносять різні елементи між органами і клітинами, відповідають за сприйняття навколишнього світу. Білки захищають нас від природних факторів і від впливів шкідливих мікроорганізмів. Без них в принципі неможливо як мінімум проходження хімічних реакцій […]...
- Характеристика пептидного зв’язку Пептидная зв’язок має характеристику частково подвійного зв’язку, тому вона коротше, ніж інші зв’язку пептидного кістяка, і внаслідок цього мало рухлива. Електронна будова пептидного зв’язку визначає плоску жорстку структуру пептидного групи. Площині пептидних груп розташовані під кутом один до одного (рис. 1-1). Зв’язок між а-вуглецевим атомом і а-ами-ногруппой або а-карбоксильною групою здатна до вільного обертання (хоча […]...
- Склад і будова білків До складу білків входять: вуглець, водень, азот, кисень; сірка. Частина білків утворює комплекси з іншими молекулами, що містять фосфор, залізо, цинк і мідь. Білки становлять 10-20% від сирої маси і 50-80% від сухої маси клітини. Білки – високомолекулярні органічні речовини, нерегулярні полімери, мономерами яких є залишки амінокислот. До складу більшості білків входять 20 різних амінокислот […]...
- Хвороби, пов’язані з порушенням фолдинга білків Розрахунки показали, що лише невелика частина теоретично можливих варіантів поліпептидних ланцюгів може приймати одну стабільну просторову структуру. Більшість же таких білків може приймати безліч конформацій з приблизно однаковою енергією Гіббса, але з різними властивостями. Первинна структура більшості відомих білків, відібраних еволюцією, забезпечує виняткову стабільність однієї конформації. Однак деякі розчинні у воді білки при зміні умов […]...
- Вміст білків в органах і тканинах Найбільш багаті білковими речовинами тканини і органи тварин. Джерелом білка є також мікроорганізми і рослини. Більшість білків добре розчинно у воді. Деякі органічні речовини, виділені з хряща, волосся, нігтів, рогів, кісткової тканини і нерозчинні у воді, також були віднесені до білків, оскільки за своїм хімічним складом виявилися близькі до білків м’язової тканини, сироватки крові, яйця. […]...
- Сортування білків і локалізація в клітці метаболічних процесів У кожному мембранном органоїд є свій набір ферментів, який визначає, які процеси будуть в ньому відбуватися. Набори білків створюються в результаті їх сортування, яка здійснюється в кілька етапів. На кожному етапі одні білки розпізнаються іншими: вибірково здійснюється транспорт білків через мембрани, вибірково збираються білки в транспортні бульбашки і бульбашки вибірково зливаються з мембранами клітинних органел. […]...
- Конформаційна лабільність білків Гідрофобні взаємодії, а також іонні та водневі зв’язки відносять до числа слабких, так як їх енергія лише ненабагато перевищує енергію теплового руху атомів при кімнатній температурі (тобто вже при даній температурі можливий розрив таких зв’язків). Підтримання характерною для білка конфор-мації можливо завдяки виникненню безлічі слабких зв’язків між різними ділянками поліпептидного ланцюга. Однак білки складаються з […]...
- Білки – загальна характеристика Одними з найбільш важливих органічних компонентів живого є білки. Друге їх назва – протеїни (від грец. Протос – перший). Білки – полімери з великою молекулярною масою від декількох десятків до декількох мільйонів одиниць. Їх мономерами служать амінокислоти. Кількість амінокислот у молекулах різних білків може коливатися від 3-5 до кількох тисяч. Наприклад, молекула білка рібонуклеази складається […]...
- Групи білків плазми крові Плазма крові містить суміш білків, різних як за походженням, так і за їх функції. Для багатьох білків їх функції ще не встановлені. У сироватці крові ідентифіковано кілька десятків індивідуальних білків, що мають діагностичне значення. У патологічних ситуаціях змінюється головним чином не загальне вміст білка, а значно збільшуються або зменшуються окремі його складові з появою у […]...
- Біосинтез білків Біосинтез білка – це один з найважливіших процесів обміну речовин в клітині. В ході такого синтезу формуються біополімери – складні молекули білків, які складаються з мономерів – амінокислот. Біосинтез білків протікає в цитоплазмі клітини, а точніше – на рибосомах за участю матричної РНК – мРНК (ще її називають інформаційною РНК – іРНК) і транспортної РНК […]...
- Фізико-хімічні властивості білків Білки проявляють властивості амфотерності (від грец. “Подвійність). Вони можуть в залежності від різних факторів проявляти як кислотні, так і основні властивості. Також білки можуть бути розчинних або не розчинних у воді. На розчинність можуть впливати як сама структура білка, так і характер розчинника, pH самого розчину або іонна сила. Білки можуть бути гідрофобними або гідрофільними. […]...
- Фізіологія травного центру Перші уявлення про будову і функції травного центру були узагальнені Павловим в 1911 р За сучасними уявленнямихарчової центр – це сукупність нейронів, розташованих на різних рівнях ЦНС, основна функція яких полягає в регуляції діяльності системи травлення та забезпеченні адаптації до потреб організму. В даний час виділені наступне рівні: 1) спинальний; 2) бульбарний; 3) гипоталамический; 4) […]...
- Користь активного відпочинку Активний відпочинок – це будь-яка діяльність людини, що несе фізичні навантаження, і не викликає морального стомлення. Спортивні ігри, прогулянки по місту, копання грядок на дачі (якщо вам це в радість), танці. Активним відпочинком можна назвати все що завгодно. Головний принцип полягає в тому, щоб ця діяльність не була для вас тягарем. Щоб ви отримували від […]...
- Біосинтез білків в прокаріотичній клітині Білковий синтез в клітинах прокаріотів організований в принципі так само, як в еукаріот. Однак є ряд відмінностей. Так, мова йде про менших розмірах рибосоми (70S) та будують її субодиниць (50S і 30S). Основу великої субодиниці прокариотической рибосоми становлять молекули рРНК двох (відсутній 5S рРНК), а не трьох різних типів. Кількість рибосомальних білків менше – З4 […]...
- Білки. Функції білків Повноцінний раціон харчування людини повинен складатися з достатньої кількості поживних речовин, серед яких білкам відведено чільне місце. Значення цього макронутриентов важко переоцінити, оскільки його присутність визначає існування всього організму. Вся життєдіяльність індивіда: зростання, розвиток, рух, захист і регулювання – по суті, пов’язана з цими полімерами. При цьому кожна жива істота має неповторний набором білків. Проте, […]...
- Синтез вірусних білків У вірусінфікованій клітині синтезуються дві групи білків: неструктурні білки, що обслуговують різні етапи репродукції вірусу; структурні білки, які входять до складу віріона (нуклеопротеїнами, пов’язані з геномом вірусу, капсидних і оболонкові білки). До неструктурних білків відносяться: ферменти синтезу нуклеїнових кислот (РНКілі ДНК-полімерази), що забезпечують транскрипцію і реплікацію вірусного генома; білки-регулятори; попередники вірусних білків, що відрізняються своєю […]...
- Характеристика героїв роману “Подорож до центру землі” У центрі роману стоїть образ професора Гамбурзького Іоганнеума Отто Ліденброк, що відкриває галерею образів вчених-диваків, ентузіастів і фанатиків науки. Якщо Фергюссон був позбавлений рисок комізму і дивацтва, то Ліденброк з надлишком наділений ними. Радянська жюльверніана (К. Андрєєв, Є. Брандіс, 3. Потапова) справедливо відзначала, що головним героєм “Незвичайних подорожей” стає людина науки, а саме дослідження, науковий […]...
- Нервова регуляція активності нейронів дихального центру Нервова регуляція здійснюється в основному рефлекторними шляхами. Виділяють дві групи впливів: епізодичні та постійні. До постійних відносяться три види: 1) від периферичних хеморецепторів серцево-судинної системи (рефлекс Гейманса); 2) від пропріорецепторов дихальних м’язів; 3) від нервових закінчень розтягувань легеневої тканини. У процесі дихання м’язи скорочуються і розслабляються. Імпульси від пропріорецепторов надходять в ЦНС одночасно до рухових […]...
- Транслокація білків. Шаперони Транслокация білків Перенесення білків через біомембрани здійснюється спеціальними транспортними системами. 1. порінових комплекс. З цитоплазми в ядро (див. С. 210) білки потрапляють через великий (125000 кДа) заповнений водою порінових комплекс. Транспорт білків через комплекс енергозавісім і тому може регулюватися Ядерні білки несуть одну або декілька сигнальних послідовностей (див. С. 232), за допомогою яких вони зв’язуються […]...
- Коротка характеристика ферментів Ферменти (біологічні каталізатори) – це речовини, невеликі кількості яких змінюють швидкість і склад кінцевих продуктів біохімічних реакцій, що протікають в живих організмах. Біологічні каталізатори, як і неорганічні каталізатори, в результаті реакції залишаються хімічно незмінними, а в процесі реакції зазнають змін, утворюючи з субстратом (речовинами, що вступають в реакцію) проміжний активоване комплекс. Ферменти, на відміну від […]...
- Участь білків в канцерогенезі У підтримці злоякісного статусу клітини можуть відігравати ключову роль деякі субодиниці білків ОФ за умови їх надлишку в клітці. У зв’язку з цим увагу привертають субодиниці 1 і 2 цитохром-оксидази, оскільки активація транскрипції генів цих субодиниць часто пов’язана зі злоякісним переродженням клітини. Важливо відзначити, що підвищення транскрипционной активності гена СОХ-П в пухлинах не залежить від […]...
- Пластичний і енергетичний обмін, значення білків і жирів для організму Основною властивістю організму є здійснення ним постійного обміну речовин і енергії з навколишньою його зовнішнім середовищем. Це показує, що обмін речовин і енергії між організмом людини і навколишнім середовищем протікає безперервно. Обмін речовин організму з зовнішнім середовищем починається з надходження в нього тварин і рослинних продуктів або води і мінеральних речовин. Їжа з тваринних і […]...
- Характеристика РНК Мономерами РНК є рибонуклеотиди, утворені залишками трьох речовин: пятиуглеродного цукру – рибози; азотистих основ – з пуринових – аденіном або гуаніном, з піримідинових – урацилом або цитозином; залишком фосфорної кислоти. Молекула РНК являє собою нерозгалужений полинуклеотид, що має третинну структуру. На відміну від ДНК, вона утворена не двома, а однією полинуклеотидной ланцюжком. Ланцюга РНК значно […]...
- Теорія центру сну Теорія центру сну виникла в результаті вивчення мозку людей, загиблих від епідемії летаргічного енцефаліту. Виявилося, що у них є зміни в задній стінці третього шлуночка мозку і в стінках сильвиева водопроводу, тобто на кордоні середнього та проміжного мозку. Ця ділянка був названий центром сну, а ділянка наперед від нього – центром неспання (Економо, 1916-1917). Ймовірно, […]...
- Твір по “Подорож до центру Землі” Мені наснилося, що я з друзями досліджую центр Землі. І що ми вирушаємо туди в експедицію на дивовижному апараті, який проходить крізь матерію. Як у казці, де чарівники можуть проходити невидимкою крізь стіни, так і ми проїжджали крізь земні шари. Тільки, напевно, наш апарат проходив до центру Землі через паралельне вимір. Може бути, такі види […]...
- Характеристика та роль рибосом в клітці Рибосоми є клітинними органелами, які складаються з РНК і білків. Вони відповідають за біосинтез білків клітини. Залежно від рівня білка в конкретній клітці, кількість рибосом може досягати мільйонів. Відмінні характеристики Рибосоми зазвичай складаються з двох субодиниць: великої субодиниці і малої субодиниці. Рибосомні субодиниці синтезуються в ядерце і перетинають ядерну мембрану в цитоплазмі через ядерні пори. […]...
- Біосинтез білка – загальна характеристика Білки – єдині органічні речовини клітини (крім нуклеїнових кислот), біосинтез яких здійснюється під прямим контролем її генетичного апарату. Сама збірка білкових молекул здійснюється в цитоплазмі клітини і являє собою багатоетапний процес, для якого потрібні певні умови і ряд компонентів. Умови та компоненти біосинтезу білка. Біосинтез білка залежить від діяльності різних видів РНК. Інформаційна РНК (іРНК) […]...
- Процедура ассессмент-центру Ассессмент-центр (АЦ) – являє собою спеціально підібраний набір тестових завдань для учасників. В даний час АЦ – затребуваний і, як вважають багато дослідників, ефективний спосіб оцінки навичок, ділових якостей і знань співробітників. Цілі ассессмент-центру Метою АЦ є з’ясування, наскільки професійні компетенції співробітника відповідають ідеальному профілю компетенцій для певної посади, чи є у нього потенціал для […]...
- Характеристика РНК (будова молекул, класифікація, еколого-біологічна роль) РНК (РНК) є продуктами реакції поліконденсації РНК-нуклеотидів. РНК різноманітні, мають певну класифікацію, але володіють загальною для всіх РНК первинною структурою, що складається в тому, що всі вони є послідовністю залишків РНК-нуклеотидів в одинарному полінуклеотидному ланцюзі; ці залишки пов’язані один з одним залишком фосфорної кислоти через 3-5-й атоми вуглецю рибози різних нуклеозидів. До складу РНК входять […]...
- Визначення амінокислотного складу білка Перший етап у визначенні первинної структури білків полягає в якісній і коічественной оцінці амінокислотного складу даного індивідуального білка. Необхідно пам’ятати, що для дослідження потрібно мати певну кількість чистого білка, без домішок інших білків або пептидів. Кислотний гідроліз білка Для визначення амінокислотного складу необхідно провести руйнування всіх пептидних зв’язків в білку. Аналізований білок гід-Роліз в 6 […]...
- Вторинні структури білків Певні поєднання двогранних кутів φ і ψ (див. С. 72) зустрічаються в білках досить часто. Якщо безліч послідовно пов’язаних амінокислотних залишків приймає стандартні конформації, формуються вторинні структури, стабілізовані водневими містками в межах однієї пептидного ланцюга або між сусідніми ланцюгами. Якщо така регулярна структура поширюється на досить великий фрагмент молекули білка, такий білок утворює механічно міцні […]...
- Де утворюються рибосоми Складові частини органоїда утворюються в ядерці. Дві субодиниці об’єднуються для початку хімічного процесу синтезу білка з ланцюга мРНК. Рибосома діє як каталізатор, утворюючи пептидні зв’язку між амінокислотами. Використана тРНК вивільняється назад в цитозоль, в подальшому вона може зв’язуватися з іншого амінокислотою. Органоїд досягне стоп-кодону мРНК (UGA, UAG і UAA), зупинивши процес синтезу. Спеціальні білки (фактори […]...
- Пластичний обмін речовин Суть пластичного обміну полягає в тому, що з простих речовин, що надходять в клітину ззовні, утворюються речовини клітини. Розглянемо цей процес на прикладі освіти найважливіших органічних сполук клітини – білків. У синтезі білка – цьому складному, многоступенчатом процесі – беруть участь ДНК, мРНК, тРНК, рибосоми, АТФ і різноманітні ферменти. Початковий етап білкового синтезу – утворення […]...