Роль шаперонів в фолдінгі білків
При синтезі білків N-кінцева область поліпептиду синтезується раніше, ніж С-кон-цевая область. Для формування конформації білка потрібна його повна амінокислотна послідовність. Тому в період синтезу білка на рибосоме захист реакційно-спосіб-них радикалів (особливо гідрофобних) здійснюють Ш-70.
Ш-70-висококонсерватівний клас білків, який присутній у всіх відділах клітини: цитоплазмі, ядрі, ЕР, мітохондріях. В області карбоксильного кінця єдиною поліпептидного ланцюга шаперонов є ділянка, утворений радикалами амінокислот у формі борозенки. Він здатний взаємодіяти з ділянками білкових молекул і розгорнутих поліпептидних ланцюгів довжиною в 7-9 амінокислот, збагачених гідрофобними радикалами. У синтезирующейся поліпептидного ланцюга такі ділянки зустрічають приблизно через кожні 16 амінокислот.
Фолдинг багатьох високомолекулярних білків, що мають складну конформацію (наприклад, доменне будова), здійснюється в спеціальному просторі, сформованому Ш-60. Ш-60 функціонують у вигляді олігомерного комплексу, що складається з 14 субодиниць (рис. 1-23).
Ш-60 утворюють 2 кільця, кожне з яких складається з 7 субодиниць, з’єднаних один з одним. Субодиниця Ш-60 складається з 3 доменів: апікального (верхівкового), проміжного і екваторіального. Верхівковий домен має ряд гідрофобних залишків, звернених у порожнину кільця, сформованого субодиницями. Екваторіальний домен має ділянку зв’язування з АТФ і володіє АТФ-азной активністю, тобто здатний гідролізувати АТФ до АДФ і Н3Р04.
Шапероновий комплекс має високу спорідненість до білків, на поверхні яких є елементи, характерні для несвернутих молекул (насамперед ділянки, збагачені гідрофобними радикалами). Потрапляючи в порожнину шаперонового комплексу, білок зв’язується з гідрофобними радикалами апікальних ділянок Ш-60. У специфічній середовищі цієї порожнини, в ізоляції від інших молекул клітини відбувається перебір можливих конформацій білка, поки не буде знайдена єдина, енергетично найбільш вигідна конформація.
Related posts:
- Конформаційна лабільність білків Гідрофобні взаємодії, а також іонні та водневі зв’язки відносять до числа слабких, так як їх енергія лише ненабагато перевищує енергію теплового руху атомів при кімнатній температурі (тобто вже при даній температурі можливий розрив таких зв’язків). Підтримання характерною для білка конфор-мації можливо завдяки виникненню безлічі слабких зв’язків між різними ділянками поліпептидного ланцюга. Однак білки складаються з […]...
- Характеристика активного центру білків Активний центр білка-відносно ізольований від навколишнього білок середовища ділянку, сформований амінокислотними залишками. У цьому ділянці кожен залишок завдяки своєму індивідуальним розміром і функціональних групах формує ” рельєф ” активного центру. Об’єднання таких амінокислот в єдиний функціональний комплекс змінює реакційну здатність їх радикалів, подібно до того, як змінюється звучання музичного інструменту в ансамблі. Тому амінокислотні залишки, […]...
- Роль білків у розвитку клітини Білки. Білки складають близько 15% протоплазми і є дуже важливим компонентом клітини. Білки складаються з амінокислот; до складу великих білкових молекул входить до тисячі амінокислотних залишків. Наприклад, в молекулі гемоглобіну (червоний пігмент крові) міститься приблизно 600 амінокислот. В даний час відомо близько 30 видів амінокислот, які входять в білки, утворюючи безліч комбінацій. Склад білків специфічний […]...
- Сортування білків Транспорт білків Біосинтез білків починається на вільних рибосомах (на схемі вгорі). Однак незабаром шляху синтезованих білків розходяться відповідно до їх функцією: білки, що несуть на N-кінці сигнальний пептид для ЕР (1), проходять через секреторний шлях (на схемі праворуч), а інші білки, що не мають цієї сигнальної послідовності, слідують по цитоплазматичних шляху (на схемі зліва). Секреторний […]...
- Первинна структура білків Амінокислотні залишки в пептидного ланцюга білків чергуються не випадковим чином, а розташовані в певному порядку. Лінійну послідовність амінокислотних залишків у поліпептидному ланцюзі називають ” первинна структура білка “. Первинна структура кожного індивідуального білка закодована в ділянці ДНК, званому геном. У процесі синтезу білка інформація, що знаходиться в гені, спочатку переписується на мРНК, а потім, використовуючи […]...
- Будова білків – коротко Беки відносяться до лінійних полімерів. У їх складі можуть бути присутні кілька α-аміокіслот і неаміноктслотні компоненти. На перший погляд все 20 амінокислот – це невеликий вибір. Але насправді молекула білка, що складається всього з 5 компонентів амінокислот, може мати понад мільйон варіантів побудови. Невеликий білок може мати в своїй ланцюжку сотню амінокислотних залишків. При синтезі […]...
- Денатурація білків Розрив великої кількості слабких зв’язків в молекулі білка призводить до руйнування її нативної конформації. Так як розрив зв’язків під дією різних факторів носить випадковий характер, то молекули одного індивідуАльного білка набувають у розчині форму випадково сформованих безладних клубків, що відрізняються один від одного тривимірною структурою. Втрата нативної конформації супроводжується втратою специфічної функції білків. Цей процес […]...
- Сортування білків і локалізація в клітці метаболічних процесів У кожному мембранном органоїд є свій набір ферментів, який визначає, які процеси будуть в ньому відбуватися. Набори білків створюються в результаті їх сортування, яка здійснюється в кілька етапів. На кожному етапі одні білки розпізнаються іншими: вибірково здійснюється транспорт білків через мембрани, вибірково збираються білки в транспортні бульбашки і бульбашки вибірково зливаються з мембранами клітинних органел. […]...
- Хвороби, пов’язані з порушенням фолдинга білків Розрахунки показали, що лише невелика частина теоретично можливих варіантів поліпептидних ланцюгів може приймати одну стабільну просторову структуру. Більшість же таких білків може приймати безліч конформацій з приблизно однаковою енергією Гіббса, але з різними властивостями. Первинна структура більшості відомих білків, відібраних еволюцією, забезпечує виняткову стабільність однієї конформації. Однак деякі розчинні у воді білки при зміні умов […]...
- Згортання білків Інформація щодо біологічно активної (нативної) конформації поліпептидного ланцюга закодована в амінокислотної послідовності. Вторинні, третинні і четвертинні структури багатьох білків утворюються в розчині мимовільно в межах декількох хвилин. Проте в клітці є спеціальні білки (шаперони, див. С. 230), функція яких забезпечувати згортання поліпептидних ланцюгів знову синтезованих білків. З’ясування закономірностей згортання поліпептидних ланцюгів є однією з найважливіших […]...
- Біосинтез білків Біосинтез білка – це один з найважливіших процесів обміну речовин в клітині. В ході такого синтезу формуються біополімери – складні молекули білків, які складаються з мономерів – амінокислот. Біосинтез білків протікає в цитоплазмі клітини, а точніше – на рибосомах за участю матричної РНК – мРНК (ще її називають інформаційною РНК – іРНК) і транспортної РНК […]...
- Перетравлювання і всмоктування білків Перетравлення білків починається в шлунку. Пепсин гідролізує 10 – 15% білків їжі. Ендопептідази (трипсин, хімотрипсин) розщеплюють білки до поліпептидів; екзопептідази отщепляют амінокислоти. Під впливом ендо – і екзопептідази панкреатичного соку і ферментів щіткової облямівки еритроцитів поліпептиди і оліго-пептиди розщеплюються до амінокислот, які транспортуються через мембрану в цитозоль клітин епітелій. Частина оліго-пептидів піддається внутрімембранному переварюванню, расщепляясь […]...
- Характеристика та роль рибосом в клітці Рибосоми є клітинними органелами, які складаються з РНК і білків. Вони відповідають за біосинтез білків клітини. Залежно від рівня білка в конкретній клітці, кількість рибосом може досягати мільйонів. Відмінні характеристики Рибосоми зазвичай складаються з двох субодиниць: великої субодиниці і малої субодиниці. Рибосомні субодиниці синтезуються в ядерце і перетинають ядерну мембрану в цитоплазмі через ядерні пори. […]...
- Фізико-хімічні властивості білків Білки проявляють властивості амфотерності (від грец. “Подвійність). Вони можуть в залежності від різних факторів проявляти як кислотні, так і основні властивості. Також білки можуть бути розчинних або не розчинних у воді. На розчинність можуть впливати як сама структура білка, так і характер розчинника, pH самого розчину або іонна сила. Білки можуть бути гідрофобними або гідрофільними. […]...
- Транслокація білків. Шаперони Транслокация білків Перенесення білків через біомембрани здійснюється спеціальними транспортними системами. 1. порінових комплекс. З цитоплазми в ядро (див. С. 210) білки потрапляють через великий (125000 кДа) заповнений водою порінових комплекс. Транспорт білків через комплекс енергозавісім і тому може регулюватися Ядерні білки несуть одну або декілька сигнальних послідовностей (див. С. 232), за допомогою яких вони зв’язуються […]...
- Регуляція білкового синтезу Значна частина синтезованих клітиною білків в залежності від їх функціонального призначення або переноситься через мембрани, або вбудовується в них. Проникнення білків через біологічні мембрани, так само як і їх вбудовування в мембрани, здійснюється за допомогою сигнальних пептидів. Таке припущення вперше було висловлено на початку 70-х років Г. Блобель. В даний час ця гіпотеза підтверджена експериментально. […]...
- Будову білка 1. Амінокислоти. Пептидний зв’язок. Амінокислоти, з’єднані один з одним послідовно, утворюють первинну структуру білка, або поліпептидного ланцюга. Кожна амінокислота має групу – NH2, яка має властивості підстави, і групу – СООН, характерну для всіх органічних кислот. Отже, амінокислоти – амфотерні сполуки, що поєднують властивості кислоти і основи. Вони здатні взаємодіяти один з одним. Взаємодіючи з […]...
- Вміст білків в органах і тканинах Найбільш багаті білковими речовинами тканини і органи тварин. Джерелом білка є також мікроорганізми і рослини. Більшість білків добре розчинно у воді. Деякі органічні речовини, виділені з хряща, волосся, нігтів, рогів, кісткової тканини і нерозчинні у воді, також були віднесені до білків, оскільки за своїм хімічним складом виявилися близькі до білків м’язової тканини, сироватки крові, яйця. […]...
- Значення білків для організму Як ми побачили з вищенаведених функцій і особливостей, білки мають величезне значення для організму людини. Вони надають форму клітин і тканин організму, переносять різні елементи між органами і клітинами, відповідають за сприйняття навколишнього світу. Білки захищають нас від природних факторів і від впливів шкідливих мікроорганізмів. Без них в принципі неможливо як мінімум проходження хімічних реакцій […]...
- Склад і будова білків До складу білків входять: вуглець, водень, азот, кисень; сірка. Частина білків утворює комплекси з іншими молекулами, що містять фосфор, залізо, цинк і мідь. Білки становлять 10-20% від сирої маси і 50-80% від сухої маси клітини. Білки – високомолекулярні органічні речовини, нерегулярні полімери, мономерами яких є залишки амінокислот. До складу більшості білків входять 20 різних амінокислот […]...
- Пластичний обмін речовин Суть пластичного обміну полягає в тому, що з простих речовин, що надходять в клітину ззовні, утворюються речовини клітини. Розглянемо цей процес на прикладі освіти найважливіших органічних сполук клітини – білків. У синтезі білка – цьому складному, многоступенчатом процесі – беруть участь ДНК, мРНК, тРНК, рибосоми, АТФ і різноманітні ферменти. Початковий етап білкового синтезу – утворення […]...
- Характеристика РНК (будова молекул, класифікація, еколого-біологічна роль) РНК (РНК) є продуктами реакції поліконденсації РНК-нуклеотидів. РНК різноманітні, мають певну класифікацію, але володіють загальною для всіх РНК первинною структурою, що складається в тому, що всі вони є послідовністю залишків РНК-нуклеотидів в одинарному полінуклеотидному ланцюзі; ці залишки пов’язані один з одним залишком фосфорної кислоти через 3-5-й атоми вуглецю рибози різних нуклеозидів. До складу РНК входять […]...
- Матричний характер біосинтезу Пластичний обмін (асиміляція, або конструктивний обмін) – сукупність всіх процесів синтезу складних органічних речовин. Ці речовини йдуть на побудову органел клітини, на створення нових клітин при діленні. Пластичний обмін завжди супроводжується поглинанням енергії. Розглянемо цей процес на прикладі утворення найважливіших органічних сполук клітини – білків. Структура білка визначається ділянкою молекули ДНК, званим геном. Кожні три […]...
- Де утворюються рибосоми Складові частини органоїда утворюються в ядерці. Дві субодиниці об’єднуються для початку хімічного процесу синтезу білка з ланцюга мРНК. Рибосома діє як каталізатор, утворюючи пептидні зв’язку між амінокислотами. Використана тРНК вивільняється назад в цитозоль, в подальшому вона може зв’язуватися з іншого амінокислотою. Органоїд досягне стоп-кодону мРНК (UGA, UAG і UAA), зупинивши процес синтезу. Спеціальні білки (фактори […]...
- Будова пептиду Кількість амінокислот у складі пептидів може сильно варіювати. Пептиди, що містять до 10 амінокислот, називають олігопептиди. Часто в назві таких молекул вказують кількість входять до складу олигопептида амінокислот : трипептид, пентапептид, октапептид і т. д. Пептиди, що містять більше 10 амінокислот, називають ” поліпептвди “, а поліпептиди, що складаються з більш ніж 50 амінокислотних залишків, […]...
- Послідовність процесорів біосинтезу білка Біосинтез білка – складний механізм, який включає в себе два вище згаданих етапу, а саме транскрипцію і трансляцію. Першим відбувається транскрибіємий етап (він розділяється на дві події). Після йде трансляція, в якій беруть участь всі види РНК, у кожної є своя функція: Інформаційна – роль матриці. Транспортна – додавання амінокислот, визначення кодонів. Рибосомна – освіту […]...
- Білки: характеристика та властивості Які речовини називаються білками або протеїнами? Білки, або протеїни, являють собою біологічні полімери, мономерами яких є амінокислоти. Всі амінокислоти мають аміногрупу (-NH2) і карбоксильну групу (-СООН) і розрізняються будовою і властивостями радикалів. Амінокислоти пов’язані між собою пептидними зв’язками, тому білки називають ще поіипептидами. Що таке первинна структура білка? У молекулі білка амінокислоти пов’язані один з […]...
- Синтез вірусних білків У вірусінфікованій клітині синтезуються дві групи білків: неструктурні білки, що обслуговують різні етапи репродукції вірусу; структурні білки, які входять до складу віріона (нуклеопротеїнами, пов’язані з геномом вірусу, капсидних і оболонкові білки). До неструктурних білків відносяться: ферменти синтезу нуклеїнових кислот (РНКілі ДНК-полімерази), що забезпечують транскрипцію і реплікацію вірусного генома; білки-регулятори; попередники вірусних білків, що відрізняються своєю […]...
- Біосинтез білка – загальна характеристика Білки – єдині органічні речовини клітини (крім нуклеїнових кислот), біосинтез яких здійснюється під прямим контролем її генетичного апарату. Сама збірка білкових молекул здійснюється в цитоплазмі клітини і являє собою багатоетапний процес, для якого потрібні певні умови і ряд компонентів. Умови та компоненти біосинтезу білка. Біосинтез білка залежить від діяльності різних видів РНК. Інформаційна РНК (іРНК) […]...
- Групи білків плазми крові Плазма крові містить суміш білків, різних як за походженням, так і за їх функції. Для багатьох білків їх функції ще не встановлені. У сироватці крові ідентифіковано кілька десятків індивідуальних білків, що мають діагностичне значення. У патологічних ситуаціях змінюється головним чином не загальне вміст білка, а значно збільшуються або зменшуються окремі його складові з появою у […]...
- Біосинтез білка: біохімія В процесі біосинтезу білка слід розрізняти два послідовних процесу: транскрипцію і трансляцію. При транскрипції генетична інформація, ув’язнена в молекулі ДНК, листується завдяки дії транскриптази в інформаційну РНК (іРНК). У цитоплазмі на рибосомах іРНК визначає порядок з’єднання амінокислот, здійснюючи таким чином синтез специфічного білка. Цей процес називається трансляцією, в ньому можна виділити кілька послідовних етапів: активацію […]...
- Матричні біосинтези Синтез нерегулярних лінійних полімерів – білків і нуклеїнових кислот – відбувається матричним способом. Тільки таким чином можна точно відтворити послідовність мономерів в полімерній молекулі. При синтезі ДНК матрицями служать кожна з ланцюгів “материнської” молекули ДНК. Вибір потрібних нуклеотидів для будівництва нового ланцюга здійснюється за принципом їх комплементарності. Результатом синтезу є дві подвійні “дочірні” спіралі, кожна […]...
- Формування віріонів Білки і нуклеїнові кислоти вірусу синтезуються в різних частинах клітини, внаслідок чого цей спосіб репродукції вірусів отримав назву діс’юнктівного (від лат. Disjunctus – роз’єднаний). Синтезовані компоненти віріона транспортуються в різні ділянки ядра або цитоплазми клітини – місця збірки вірусу, яка відбувається за участю гідрофобних, іонних, водневих зв’язків і стеричного відповідності. Формування віріонів – багатоступінчастий процес […]...
- Біосинтез білків в прокаріотичній клітині Білковий синтез в клітинах прокаріотів організований в принципі так само, як в еукаріот. Однак є ряд відмінностей. Так, мова йде про менших розмірах рибосоми (70S) та будують її субодиниць (50S і 30S). Основу великої субодиниці прокариотической рибосоми становлять молекули рРНК двох (відсутній 5S рРНК), а не трьох різних типів. Кількість рибосомальних білків менше – З4 […]...
- Які особливості реакцій біосинтезу білка в клітині У список особливостей реакцій біосинтезу варто віднести: Використання енергії АТФ для хімічних реакцій. Присутні ферменти, завдання яких прискорювати реакції. Реакція має матричний характер, так як білок синтезується на іРНК. Ознаки біосинтезу білка в клітині Для такого складного процесу, звичайно ж, характерні різні ознаки: Перший з них полягає в тому, що присутні ферменти, без яких сам […]...
- Вторинні структури білків Певні поєднання двогранних кутів φ і ψ (див. С. 72) зустрічаються в білках досить часто. Якщо безліч послідовно пов’язаних амінокислотних залишків приймає стандартні конформації, формуються вторинні структури, стабілізовані водневими містками в межах однієї пептидного ланцюга або між сусідніми ланцюгами. Якщо така регулярна структура поширюється на досить великий фрагмент молекули білка, такий білок утворює механічно міцні […]...
- Білки. Функції білків Повноцінний раціон харчування людини повинен складатися з достатньої кількості поживних речовин, серед яких білкам відведено чільне місце. Значення цього макронутриентов важко переоцінити, оскільки його присутність визначає існування всього організму. Вся життєдіяльність індивіда: зростання, розвиток, рух, захист і регулювання – по суті, пов’язана з цими полімерами. При цьому кожна жива істота має неповторний набором білків. Проте, […]...
- Механізми всмоктування вуглеводів, жирів і білків Всмоктування вуглеводів відбувається у вигляді кінцевих продуктів метаболізму (моно – і дисахаридів) у верхній третині тонкого кишечника. Глюкоза і галактоза поглинаються шляхом активного транспорту, причому всмоктування глюкози пов’язане з іонами натрію – симпорт. Манноза і пентоза надходять пасивно по градієнту концентрації глюкози. Фруктоза надходить за допомогою полегшеної дифузії. Найбільш інтенсивно йде всмоктування глюкози в кров. […]...
- Білки і субстати Визначення вмісту загального білка плазми (сироватки) крові – елемент комплексу профілактичних та лікувальних заходів вже на початковому етапі надання медичної допомоги. Більшість білків плазми крові синтезовано в гепатоцитах. Катаболізм багатьох білків плазми крові відбувається в ендотеліальних клітинах капілярів і системі функціональних фагоцитів – моноцитів і макрофагів – після поглинання білків шляхом піноцитозу. Білки з невеликою […]...
- Участь білків в канцерогенезі У підтримці злоякісного статусу клітини можуть відігравати ключову роль деякі субодиниці білків ОФ за умови їх надлишку в клітці. У зв’язку з цим увагу привертають субодиниці 1 і 2 цитохром-оксидази, оскільки активація транскрипції генів цих субодиниць часто пов’язана зі злоякісним переродженням клітини. Важливо відзначити, що підвищення транскрипционной активності гена СОХ-П в пухлинах не залежить від […]...