Роль шаперонів в фолдінгі білків

При синтезі білків N-кінцева область поліпептиду синтезується раніше, ніж С-кон-цевая область. Для формування конформації білка потрібна його повна амінокислотна послідовність. Тому в період синтезу білка на рибосоме захист реакційно-спосіб-них радикалів (особливо гідрофобних) здійснюють Ш-70.

Ш-70-висококонсерватівний клас білків, який присутній у всіх відділах клітини: цитоплазмі, ядрі, ЕР, мітохондріях. В області карбоксильного кінця єдиною поліпептидного ланцюга шаперонов є ділянка, утворений радикалами амінокислот у формі борозенки. Він здатний взаємодіяти з ділянками білкових молекул і розгорнутих поліпептидних ланцюгів довжиною в 7-9 амінокислот, збагачених гідрофобними радикалами. У синтезирующейся поліпептидного ланцюга такі ділянки зустрічають приблизно через кожні 16 амінокислот.

Фолдинг багатьох високомолекулярних білків, що мають складну конформацію (наприклад, доменне будова), здійснюється в спеціальному просторі, сформованому Ш-60. Ш-60 функціонують у вигляді олігомерного комплексу, що складається з 14 субодиниць (рис. 1-23).

Ш-60 утворюють 2 кільця, кожне з яких складається з 7 субодиниць, з’єднаних один з одним. Субодиниця Ш-60 складається з 3 доменів: апікального (верхівкового), проміжного і екваторіального. Верхівковий домен має ряд гідрофобних залишків, звернених у порожнину кільця, сформованого субодиницями. Екваторіальний домен має ділянку зв’язування з АТФ і володіє АТФ-азной активністю, тобто здатний гідролізувати АТФ до АДФ і Н3Р04.

Шапероновий комплекс має високу спорідненість до білків, на поверхні яких є елементи, характерні для несвернутих молекул (насамперед ділянки, збагачені гідрофобними радикалами). Потрапляючи в порожнину шаперонового комплексу, білок зв’язується з гідрофобними радикалами апікальних ділянок Ш-60. У специфічній середовищі цієї порожнини, в ізоляції від інших молекул клітини відбувається перебір можливих конформацій білка, поки не буде знайдена єдина, енергетично найбільш вигідна конформація.


1 Star2 Stars3 Stars4 Stars5 Stars (2 votes, average: 3.50 out of 5)

Роль шаперонів в фолдінгі білків