Дані анатомії і фізіології
У дорослих змій немає ніг, але при вивченні анатомії цих тварин у багатьох з них виявляються зачатки кісток поясів кінцівок, а у деяких, наприклад, у величезного африканського пітона, є навіть маленькі рудиментарні ноги, що проступають крізь шкіру. Рудиментарним органом називають нерозвинений і нефункціонуючий орган, еквівалентний, однак, якогось функціонуючому органу інших живих організмів. У спаржі на стеблі є рудиментарні листочки, схожі на лусочки. Вони не містять хлорофілу і взагалі не функціонують як листя. Луска ці лише доказ того, що спаржа сталася від рослини з нормально розвиненими листям.
Подібним же чином рудименти ніг у змій вказують на походження цих тварин від пересувається на ногах предка. У птахів є третя повіка, яке діє подібно щіток на вітровому склі автомобіля, підтримуючи очей вологим і очищаючи його від пилу. У ссавців третя повіка збереглося в рудиментарному стані і не функціонує. Кожен може побачити у себе третя повіка – це маленька складочка в кутку очі, біля носа. Деякі люди вміють рухати вухами, використовуючи при цьому рудиментарні вушні м’язи. Для людини ці м’язи зовсім марні. Вони, однак, сильно розвинені у собак, кроликів та інших тварин, здатних “насторожувати” вуха, щоб краще вловити найменший звук. Таких прикладів можна навести тисячі; тільки у людини налічується кілька десятків рудиментарних органів.
Явища фізіологічного подібності також вказують на еволюційну спільність живих організмів. Так, гормони одного хребетного ідентичні відповідним гормонів іншого. Чоловічий гормон, виділений з сім’яників бика, стимулює статевий розвиток курчати і поява у нього характерних ознак півня. Багатьом хворим прописують гормон бичачої щитовидної залози, і цей гормон надає абсолютно таку ж дію, як і гормон, що виробляється щитовидною залозою людини.
Паразити досягли дуже високого ступеня пристосованості до організмам, в яких вони живуть. Так, найпростіші, що викликають малярію у птахів, не діють на людину, навіть якщо їх спеціально ввести йому. Це пояснюється відмінністю в фізіології птиці і людини. Але деякі паразити заражають іноді близькоспоріднені види; саме тому мавпи і людиноподібні мавпи надзвичайно чутливі до захворювань, поширеним серед людей. З усіх хребетних тварин вірус поліомієліту вражає лише людини і мавп. Відоме захворювання – іржа пшениці – розвивається тільки на таких близькоспоріднених хлібних злаках, як жито, овес, ячмінь. Інші злаки, в тому числі кукурудза, не пошкоджуються цим грибом. Це вказує на фізіологічне схожість рослин першої групи. Аналогічні приклади можна знайти і при аналізі глистових інвазій і інших паразитарних захворювань.